尽管在Windows环境下安装R包相对简单,只需联网并执行`install.packages()`命令即可,但在Linux环境下,尤其是在使用Xshell等终端工具时,安装R包可能会稍显复杂
本文将详细介绍如何在Xshell中安装R包,涵盖从基础到进阶的各种情况,无论是在线安装还是离线安装,都将一一讲解
一、安装R及RStudio环境 在Xshell中安装R包之前,首先需要确保R和RStudio(如果需要图形界面)已经正确安装
以下是安装R的步骤: 1.登录服务器: 使用Xshell登录到你的Linux服务器
登录后,使用`cd`命令进入你想要存放R压缩包的目录
例如: bash cd ~/software 2.下载R压缩包: 使用`wget`命令下载R的压缩包
例如: bash wget https://cran.r-project.org/src/base/R-4.2.1.tar.gz 3.解压并编译R: 解压下载的压缩包并进入解压后的目录: bash tar -xzf R-4.2.1.tar.gz cd R-4.2.1 接下来,执行`./configure`命令进行配置,然后运行`make`和`makeinstall`命令进行编译和安装
4.配置环境变量: 安装完成后,需要配置环境变量,使系统能够识别R命令
编辑`~/.bash_profile`文件,添加R的安装路径到PATH中: bash vim ~/.bash_profile 在打开的文件中,添加如下行: bash export PATH=/home/your_username/software/R/bin:$PATH 保存并退出后,执行`source ~/.bash_profile`使更改生效
5.验证安装: 输入`R`命令,验证R是否成功安装
如果看到R的启动信息,则说明安装成功
此外,如果需要RStudio的图形界面,可以通过安装RStudio Server来实现
下载RStudio Server的压缩包,解压并安装,然后使用`rstudio-serverstart`命令启动服务
二、在线安装R包 在R和RStudio环境安装完成后,就可以开始安装R包了
如果Linux服务器可以联网,那么在线安装R包是最简单的方式
1.启动R: 在Xshell中,输入`R`命令启动R环境
2.安装R包: 使用`install.packages()`函数来安装R包
例如,安装`ggplot2`包: R install.packages(ggplot2) 系统会提示选择一个CRAN镜像站点,选择默认的或者一个离你较近的站点即可
安装完成后,可以使用`library(ggplot2)`来加载并使用该包
三、离线安装R包 如果Linux服务器无法联网,那么就需要采用离线安装R包的方式
离线安装R包通常有两种方法:一是手动下载R包的压缩包并安装,二是从另一台可以联网的机器上复制R包的安装目录
1.手动下载并安装R包: - 在一台可以联网的机器上,使用R的`download.packages()`函数下载R包的压缩包
例如,下载`dplyr`包: ```R download.packages(dplyr, destdir = ~/r_packages, type = source) ``` - 将下载的压缩包上传到Linux服务器的某个目录下
- 在Xshell中,进入该目录,使用`R CMD INSTALL`命令安装R包
例如: ```bash R CMD INSTALLdplyr_1.0.7.tar.gz ``` 2.从联网机器复制R包安装目录: - 在一台可以联网的Linux机器上,安装好需要的R包
- 找到R包的安装目录,通常位于`~/.R/x86_64-pc-linux-gnu-library/